中医透药疗法作为中医外治的一种重要手段，其理论基础深深植根于中医的基本理论之中。
中医理论，即中医基础理论，简称“中基”，是以**的整体理念与辨证论治、相似观（分形观）的循证观点为较大特色的传统医学体系的基础与核心。
它全面系统地阐述了人体的生理、病理现象，并用于指导临床诊疗活动。
中医基础理论的学说主要包括阴阳五行学说、脏象五系统学说、气血精津液神学说等。
阴阳学说认为，人体是一个阴阳对立的统一体，阴阳的对立制约、互根互用及转化关系维持着人体的动态平衡。
五行学说则将自然界的某些事物或现象按“木、火、土、金、水”五类属性进行归纳，用以阐释人体局部与局部、局部与整体、体表与内脏的**联系。
脏象五系统学说，即心、肝、脾、肺、肾五大系统，是中医对人体生理结构和功能的高度概括。
每个系统都涵盖了相应的脏腑、组织、器官及其生理功能，并通过经络纵横广泛地分布，以贯通内外上下，运行气血津液，滋养并调节各组织器官的活动。
例如，心系统主血脉，推动和调控血液在脉管中运行，流注全身；肺系统主气，司呼吸，朝百脉，主治节；脾系统主运化，统血，为后天之本；肝系统主疏泄，藏血，调畅气机；肾系统主藏精，主水，主纳气，为先天之本。
气血精津液神学说则进一步阐述了人体生命活动的基本物质及其相互关系。
气是构成人体和维持人体生命活动的较基本物质，具有推动、温煦、防御、固摄、气化等作用。
血是循行于脉中而富有营养的红色液态物质，是构成人体和维持人体生命活动的基本物质之一。
精是构成人体和维持人体生命活动的精微物质，包括先天之精和后天之精。
津液是机体一切正常水液的总称，包括各脏腑形体官窍的内在液体及其正常的分泌物。
神则是人体生命活动的主宰和总体体现。
中医透药疗法正是基于这些中医基本理论，通过药物作用于人体特定穴位或患处，达到调整阴阳、疏通经络、调和气血、扶正祛邪的目的，从而**疾病和保健养生。